Badan Eksekutif Mahasiswa (BEM) Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Bina Usada Bali didirikan pada tanggal 31 Desember 2009. Keberadaannya merupakan organisasi kemahasiswaan tertinggi di wilayah STIKES Bina Usada Bali. Dalam pelaksanaan fungsi-fungsi luhur keorganisasisan yang menaungi dua program studi maka bersamaan dengan dibentuknya BEM dibentuk pula Himpunan Mahasiswa (HIMA) yang menanungi program studi DIII Kebidanan yang disebut HIMA DIII Kebidanan yang beranggotakan seluruh mahasiswa kebidanan STIKES Bina Usada Bali, dan Himpunan Mahasiswa (HIMA) yang menanungi program studi S1 Keperawatan disebut HIMA S1 Keperawatan yang beranggotakan seluruh mahasiswa keperawatan STIKES Bina Usada Bali.
BEM
merupakan metamorfosa dari IKM yaitu ikatan keluarga mahasiswa. IKM dulunya
adalah organisasi kemahasiswaan yang menaungi 2 program studi tanpa kehadiran HIMA.
Karena dalam pelaksanaannya mengalami berbagai macam hambatan maka IKM yang
sekarang telah berganti nama menjadi BEM yang membentuk himpunan mahasiswa.
Periode
kepengurusan 2008-2009 BEM diketuai oleh I Gede Darma Budi Diharja yang akrab
dipanggil Darma. Kepemimpinan Darma kemudian berpindah ke Ni Wayan Krisnawati yang
terpilih menjadi ketua BEM periode 2009-2010. Melalui pemilihan umum ketua BEM
tahun 2010 maka I Wayan Suada Darma dipercaya memimpin BEM. Dalam pemerintahannya ternyata banyak
kegiatan yang menyebabkan periode jabatannya memanjang. Beliau menjabat dari
tahun 2010 hingga 2012. Pada bulan Juli 2012 diadakan pemilihan umum Ketua BEM
keempat dimana suara terbanyak diperoleh Saudari L.P. Heny Widiastuti. Selama
periode 2012-2013, L.P. Heny Widiastuti bersama rekan-rekan pengurus lainnya
akan melaksanakan fungsi BEM sebagai organisasi kemahasiswaan, banyak
kelengkapan organisasi terbentuk pada periode ini antara lain GBHO dan AD/ART
BEM. Kemudian pada tanggal 27 Juli 2013 Pemilihan umum kelima digelar dan yang
mendapatkan suara terbanyak dan terpilih sebagai Ketua BEM periode 2013-2014
adalah I Ketut Andika Priastana.